Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rtf1A2AQ19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Rtf1A2AQ19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rtf1A2AQ19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rtf1A2AQ19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rtf1A2AQ19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rtf1A2AQ19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rtf1A2AQ19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms