Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec16aA2AIX1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec16aA2AIX1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec16aA2AIX1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec16aA2AIX1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec16aA2AIX1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec16aA2AIX1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec16aA2AIX1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec16aA2AIX1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec16aA2AIX1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms