Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl2A2AGA4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl2A2AGA4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl2A2AGA4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl2A2AGA4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl2A2AGA4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rhbdl2A2AGA4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl2A2AGA4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms