Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19,56■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19,55■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19,52■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,7
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,39■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19,34■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19,34■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19,33■□□□□ 0,68
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ighv5-2A0A0A6YVX8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19,32■□□□□ 0,68
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Ighv5-2A0A0A6YVX8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms