Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQW2

Gm28363, Predicted gene 28363 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28363A0A087WQW2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28363A0A087WQW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28363A0A087WQW2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28363A0A087WQW2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28363A0A087WQW2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28363A0A087WQW2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28363A0A087WQW2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28363A0A087WQW2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28363A0A087WQW2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28363A0A087WQW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms