Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP13-4-201ENST00000334068 797 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBBP9-201ENST00000405234 1099 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97987.1-202ENST00000411708 391 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512635.1-201ENST00000414056 832 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD3BP5-201ENST00000434856 1132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFITM4P-207ENST00000441380 420 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDC1-AS1-201ENST00000442150 738 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC130689.1-201ENST00000451056 408 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN2-AS1-201ENST00000451099 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKG1-AS1-203ENST00000452247 886 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAP1P2-201ENST00000456716 1234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P8-201ENST00000482081 580 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEA1-204ENST00000518784 586 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011092.1-201ENST00000533128 1047 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS6-AS1-204ENST00000593709 648 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133520.1-201ENST00000610430 700 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM2-202ENST00000617002 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6511B2-201ENST00000636908 71 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW7-207ENST00000603841 2261 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GZMB-203ENST00000382542 666 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092162.2-203ENST00000430460 579 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf67-201ENST00000438651 765 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135924.1-201ENST00000446146 423 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093270.1-201ENST00000482584 486 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA76.1-201ENST00000516313 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003049.2-201ENST00000532992 540 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HP-207ENST00000562526 685 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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