Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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