Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 LINC00632-203ENST00000602535 723 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FANCFQ9NPI8 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms