Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Wdr48-205ENSMUST00000215307 3776 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms