Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Dsg1bQ7TSF1 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Dsg1bQ7TSF1 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Dsg1bQ7TSF1 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Dsg1bQ7TSF1 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms