Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top3bQ9Z321 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms