Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsc22d3Q9Z2S7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms