Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms