Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms