Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms