Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod2Q9R0B9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms