Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn4Q9QXZ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms