Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLE3Q9NRF9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms