Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem3Q9JKE1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms