Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd3Q9JJY3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms