Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms