Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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