Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms