Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms