Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8N1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8N1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8N1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms