Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp4bQ9D8B3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms