Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms