Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms