Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930556J24RikQ9D4U7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
4930556J24RikQ9D4U7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms