Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Fndc8Q9D2H8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Fndc8Q9D2H8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc8Q9D2H8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms