Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms