Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyc1Q9D0M3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyc1Q9D0M3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms