Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms