Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fQ9CY34 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms