Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chchd3Q9CRB9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms