Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CR55 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CR55 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CR55 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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