Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4931417E11RikQ9CR05 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms