Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atp5f1Q9CQQ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atp5f1Q9CQQ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp5f1Q9CQQ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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