Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms