Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rpl39lQ9CQD0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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