Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms