Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska1Q9CPV1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms