Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms