Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcgf6Q99NA9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms