Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms