Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlgn1Q99K10 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms