Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pacsin3Q99JB8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin3Q99JB8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms