Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms