Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms