Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rhbdd2Q8VEK2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rhbdd2Q8VEK2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rhbdd2Q8VEK2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rhbdd2Q8VEK2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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